Expozícia múzea v Kopčanoch vznikla v rámci cezhraničného projektu v priestoroch bývalej renovovanej kaplnky na prízemí objektu žrebčína. V súčasnosti je presťahovaná do novozrekonštruovaného objektu Kačenárne v blízkosti Kostola sv. Margity Antiochijskej. Hlavný dôraz je kladený na výsledky archeologického výskumu v obci, predovšetkým však najnovších výskumov Kostola sv. Margity Antiochijskej. Ďalšia časť expozície mapuje históriu obce s prihliadnutím na jej najvýznamnejšie etapy a osobnosti – obdobie za Coborovcov, Habsburgovcov a T. G. Masaryka.
Popri múzeu je po dohode možné navštíviť i Kostol sv. Margity Antiochijskej. V súčasnosti je vybudovaná nová lávka pre peších a cyklistov cez rieku Moravu, ktorá spája Kopčany s veľkomoravským arecheoparkom v Mikulčiciach na moravskej strane.